Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Plod3Q9R0E1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms