Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vav3Q9R0C8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms