Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubxn8Q9QZ49 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubxn8Q9QZ49 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms