Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Six6Q9QZ28 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Six6Q9QZ28 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms