Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nphp1Q9QY53 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms