Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nr2e3Q9QXZ7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nr2e3Q9QXZ7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms