Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf354bQ9QXT9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms