Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfmbt1Q9JMD1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfmbt1Q9JMD1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms