Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrfQ9JM73 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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