Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

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Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tgm1Q9JLF6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Tgm1Q9JLF6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tgm1Q9JLF6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tgm1Q9JLF6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tgm1Q9JLF6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Tgm1Q9JLF6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tgm1Q9JLF6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.3 ms