Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Habp4Q9JKS5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms