Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Smco4Q9JIS3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms