Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rb1cc1Q9ESK9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rb1cc1Q9ESK9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms