Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp29Q9ES63 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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