Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Capn12Q9ER56 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capn12Q9ER56 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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