Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vmn1r29Q9EQ41 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Vmn1r29Q9EQ41 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r29Q9EQ41 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r29Q9EQ41 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r29Q9EQ41 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Vmn1r29Q9EQ41 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vmn1r29Q9EQ41 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vmn1r29Q9EQ41 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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