Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trmt112Q9DCG9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trmt112Q9DCG9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms