Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Slc46a3Q9DC26 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc46a3Q9DC26 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms