Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riok3Q9DBU3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gpr33-201ENSMUST00000040161 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm14900-201ENSMUST00000120304 733 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms