Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sgf29Q9DA08 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sgf29Q9DA08 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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