Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Klhl40Q9D783 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms