Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MsraQ9D6Y7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MsraQ9D6Y7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms