Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sec23bQ9D662 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms