Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pramef12Q9D2F1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms