Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syf2Q9D198 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms