Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Tmem88Q9D0N8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tmem88Q9D0N8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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