Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Exosc7Q9D0M0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Exosc7Q9D0M0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms