Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS1

Aldh1b1, Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1b1Q9CZS1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Aldh1b1Q9CZS1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aldh1b1Q9CZS1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms