Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rpusd4Q9CWX4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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