Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ddx28Q9CWT6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddx28Q9CWT6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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