Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ly6kQ9CWP4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms