Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snw1Q9CSN1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snw1Q9CSN1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms