Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q9CRC3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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