Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ykt6Q9CQW1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms