Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Smim8Q9CQQ0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms