Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpa3Q9CQ71 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpa3Q9CQ71 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms