Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Pole4Q9CQ36 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Pole4Q9CQ36 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Pole4Q9CQ36 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Pole4Q9CQ36 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Pole4Q9CQ36 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Pole4Q9CQ36 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Pole4Q9CQ36 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Pole4Q9CQ36 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Pole4Q9CQ36 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Pole4Q9CQ36 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pole4Q9CQ36 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pole4Q9CQ36 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pole4Q9CQ36 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pole4Q9CQ36 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pole4Q9CQ36 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pole4Q9CQ36 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms