Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atg3Q9CPX6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg3Q9CPX6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms