Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lactb2Q99KR3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms