Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hps4Q99KG7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hps4Q99KG7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms