Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tlcd1Q99JT6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms