Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spdl1Q923A2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms