Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim59Q922Y2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim59Q922Y2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms