Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp3Q91W36 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp3Q91W36 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp3Q91W36 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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