Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Sft2d2Q8VD57 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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