Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk8Q8R3L8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk8Q8R3L8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms