Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CipcQ8R0W1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CipcQ8R0W1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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