Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prkd3Q8K1Y2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms