Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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SbsnQ8CIT9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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SbsnQ8CIT9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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SbsnQ8CIT9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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SbsnQ8CIT9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SbsnQ8CIT9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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