Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec10Q8CF98 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms